Uniprot ID | P19811 |
Uniprot Name | RPOA_EAVBU |
Taxonomy ID | 299386 |
Sequence |
M
A
T
F
S
A
T
G
F
G
G
S
F
V
R
D
W
S
L
D
L
P
D
A
C
E
H
G
A
G
L
C
C
E
V
D
G
S
T
L
C
A
E
C
F
R
G
C
E
G
M
E
Q
C
P
G
L
F
M
G
L
L
K
L
A
S
P
V
P
V
G
H
K
F
L
I
G
W
Y
R
A
A
K
V
T
G
R
Y
N
F
L
E
L
L
Q
H
P
A
F
A
Q
L
R
V
V
D
A
R
L
A
I
E
E
A
S
V
F
I
S
T
D
H
A
S
A
K
R
F
P
G
A
R
F
A
L
T
P
V
Y
A
N
A
W
V
V
S
P
A
A
N
S
L
I
V
T
T
D
Q
E
Q
D
G
F
C
W
L
K
L
L
P
P
D
R
R
E
A
G
L
R
L
Y
Y
N
H
Y
R
E
Q
R
T
G
W
L
S
K
T
G
L
R
L
W
L
G
D
L
G
L
G
I
N
A
S
S
G
G
L
K
F
H
I
M
R
G
S
P
Q
R
A
W
H
I
T
T
R
S
C
K
L
K
S
Y
Y
V
C
D
I
S
E
A
D
W
S
C
L
P
A
G
N
Y
G
G
Y
N
P
P
G
D
G
A
C
G
Y
R
C
L
A
F
M
N
G
A
T
V
V
S
A
G
C
S
S
D
L
W
C
D
D
E
L
A
Y
R
V
F
Q
L
S
P
T
F
T
V
T
I
P
G
G
R
V
C
P
N
A
K
Y
A
M
I
C
D
K
Q
H
W
R
V
K
R
A
K
G
V
G
L
C
L
D
E
S
C
F
R
G
I
C
N
C
Q
R
M
S
G
P
P
P
A
P
V
S
A
A
V
L
D
H
I
L
E
A
A
T
F
G
N
V
R
V
V
T
P
E
G
Q
P
R
P
V
P
A
P
R
V
R
P
S
A
N
S
S
G
D
V
K
D
P
A
P
V
P
P
V
P
K
P
R
T
K
L
A
T
P
N
P
T
Q
A
P
I
P
A
P
R
T
R
L
Q
G
A
S
T
Q
E
P
L
A
S
A
G
V
A
S
D
S
A
P
K
W
R
V
A
K
T
V
Y
S
S
A
E
R
F
R
T
E
L
V
Q
R
A
R
S
V
G
D
V
L
V
Q
A
L
P
L
K
T
P
A
V
Q
R
Y
T
M
T
L
K
M
M
R
S
R
F
S
W
H
C
D
V
W
Y
P
L
A
V
I
A
C
L
L
P
I
W
P
S
L
A
L
L
L
S
F
A
I
G
L
I
P
S
V
G
N
N
V
V
L
T
A
L
L
V
S
S
A
N
Y
V
A
S
M
D
H
Q
C
E
G
A
A
C
L
A
L
L
E
E
E
H
Y
Y
R
A
V
R
W
R
P
I
T
G
A
L
S
L
V
L
N
L
L
G
Q
V
G
Y
V
A
R
S
T
F
D
A
A
Y
V
P
C
T
V
F
D
L
C
S
F
A
I
L
Y
L
C
R
N
R
C
W
R
C
F
G
R
C
V
R
V
G
P
A
T
H
V
L
G
S
T
G
Q
R
V
S
K
L
A
L
I
D
L
C
D
H
F
S
K
P
T
I
D
V
V
G
M
A
T
G
W
S
G
C
Y
T
G
T
A
A
M
E
R
Q
C
A
S
T
V
D
P
H
S
F
D
Q
K
K
A
G
A
T
V
Y
L
T
P
P
V
N
S
G
S
A
L
Q
C
L
N
V
M
W
K
R
P
I
G
S
T
V
L
G
E
Q
T
G
A
V
V
T
A
V
K
S
I
S
F
S
P
P
C
C
V
S
T
T
L
P
T
R
P
G
V
T
V
V
D
H
A
L
Y
N
R
L
T
A
S
G
V
D
P
A
L
L
R
V
G
Q
G
D
F
L
K
L
N
P
G
F
R
L
I
G
G
W
I
Y
G
I
C
Y
F
V
L
V
V
V
S
T
F
T
C
L
P
I
K
C
G
I
G
T
R
D
P
F
C
R
R
V
F
S
V
P
V
T
K
T
Q
E
H
C
H
A
G
M
C
A
S
A
E
G
I
S
L
D
S
L
G
L
T
Q
L
Q
S
Y
W
I
A
A
V
T
S
G
L
V
I
L
L
V
C
H
R
L
A
I
S
A
L
D
L
L
T
L
A
S
P
L
V
L
L
V
F
P
W
A
S
V
G
L
L
L
A
C
S
L
A
G
A
A
V
K
I
Q
L
L
A
T
L
F
V
N
L
F
F
P
Q
A
T
L
V
T
M
G
Y
W
A
C
V
A
A
L
A
V
Y
S
L
M
G
L
R
V
K
V
N
V
P
M
C
V
T
P
A
H
F
L
L
L
A
R
S
A
G
Q
S
R
E
Q
M
L
R
V
S
A
A
A
P
T
N
S
L
L
G
V
A
R
D
C
Y
V
T
G
T
T
R
L
Y
I
P
K
E
G
G
M
V
F
E
G
L
F
R
S
P
K
A
R
G
N
V
G
F
V
A
G
S
S
Y
G
T
G
S
V
W
T
R
N
N
E
V
V
V
L
T
A
S
H
V
V
G
R
A
N
M
A
T
L
K
I
G
D
A
M
L
T
L
T
F
K
K
N
G
D
F
A
E
A
V
T
T
Q
S
E
L
P
G
N
W
P
Q
L
H
F
A
Q
P
T
T
G
P
A
S
W
C
T
A
T
G
D
E
E
G
L
L
S
G
E
V
C
L
A
W
T
T
S
G
D
S
G
S
A
V
V
Q
G
D
A
V
V
G
V
H
T
G
S
N
T
S
G
V
A
Y
V
T
T
P
S
G
K
L
L
G
A
D
T
V
T
L
S
S
L
S
K
H
F
T
G
P
L
T
S
I
P
K
D
I
P
D
N
I
I
A
D
V
D
A
V
P
R
S
L
A
M
L
I
D
G
L
S
N
R
E
S
S
L
S
G
P
Q
L
L
L
I
A
C
F
M
W
S
Y
L
N
Q
P
A
Y
L
P
Y
V
L
G
F
F
A
A
N
F
F
L
P
K
S
V
G
R
P
V
V
T
G
L
L
W
L
C
C
L
F
T
P
L
S
M
R
L
C
L
F
H
L
V
C
A
T
V
T
G
N
V
I
S
L
W
F
Y
I
T
A
A
G
T
S
Y
L
S
E
M
W
F
G
G
Y
P
T
M
L
F
V
P
R
F
L
V
Y
Q
F
P
G
W
A
I
G
T
V
L
A
V
C
S
I
T
M
L
A
A
A
L
G
H
T
L
L
L
D
V
F
S
A
S
G
R
F
D
R
T
F
M
M
K
Y
F
L
E
G
G
V
K
E
S
V
T
A
S
V
T
R
A
Y
G
K
P
I
T
Q
E
S
L
T
A
T
L
A
A
L
T
D
D
D
F
Q
F
L
S
D
V
L
D
C
R
A
V
R
S
A
M
N
L
R
A
A
L
T
S
F
Q
V
A
Q
Y
R
N
I
L
N
A
S
L
Q
V
D
R
D
A
A
R
S
R
R
L
M
A
K
L
A
D
F
A
V
E
Q
E
V
T
A
G
D
R
V
V
V
I
D
G
L
D
R
M
A
H
F
K
D
D
L
V
L
V
P
L
T
T
K
V
V
G
G
S
R
C
T
I
C
D
V
V
K
E
E
A
N
D
T
P
V
K
P
M
P
S
R
R
R
R
K
G
L
P
K
G
A
Q
L
E
W
D
R
H
Q
E
E
K
R
N
A
G
D
D
D
F
A
V
S
N
D
Y
V
K
R
V
P
K
Y
W
D
P
S
D
T
R
G
T
T
V
K
I
A
G
T
T
Y
Q
K
V
V
D
Y
S
G
N
V
H
Y
V
E
H
Q
E
D
L
L
D
Y
V
L
G
K
G
S
Y
E
G
L
D
Q
D
K
V
L
D
L
T
N
M
L
K
V
D
P
T
E
L
S
S
K
D
K
A
K
A
R
Q
L
A
H
L
L
L
D
L
A
N
P
V
E
A
V
N
Q
L
N
L
R
A
P
H
I
F
P
G
D
V
G
R
R
T
F
A
D
S
K
D
K
G
F
V
A
L
H
S
R
T
M
F
L
A
A
R
D
F
L
F
N
I
K
F
V
C
D
E
E
F
T
K
T
P
K
D
T
L
L
G
Y
V
R
A
C
P
G
Y
W
F
I
F
R
R
T
H
R
S
L
I
D
A
Y
W
D
S
M
E
C
V
Y
A
L
P
T
I
S
D
F
D
V
S
P
G
D
V
A
V
T
G
E
R
W
D
F
E
S
P
G
G
G
R
A
K
R
L
T
A
D
L
V
H
A
F
Q
G
F
H
G
A
S
Y
S
Y
D
D
K
V
A
A
A
V
S
G
D
P
Y
R
S
D
G
V
L
Y
N
T
R
W
G
N
I
P
Y
S
V
P
T
N
A
L
E
A
T
A
C
Y
R
A
G
C
E
A
V
T
D
G
T
N
V
I
A
T
I
G
P
F
P
E
Q
Q
P
I
P
D
I
P
K
S
V
L
D
N
C
A
D
I
S
C
D
A
F
I
A
P
A
A
E
T
A
L
C
G
D
L
E
K
Y
N
L
S
T
Q
G
F
V
L
P
S
V
F
S
M
V
R
A
Y
L
K
E
E
I
G
D
A
P
P
L
Y
L
P
S
T
V
P
S
K
N
S
Q
A
G
I
N
G
A
E
F
P
T
K
S
L
Q
S
Y
C
L
I
D
D
M
V
S
Q
S
M
K
S
N
L
Q
T
A
T
M
A
T
C
K
R
Q
Y
C
S
K
Y
K
I
R
S
I
L
G
T
N
N
Y
I
G
L
G
L
R
A
C
L
S
G
V
T
A
A
F
Q
K
A
G
K
D
G
S
P
I
Y
L
G
K
S
K
F
D
P
I
P
A
P
D
K
Y
C
L
E
T
D
L
E
S
C
D
R
S
T
P
A
L
V
R
W
F
A
T
N
L
I
F
E
L
A
G
Q
P
E
L
V
H
S
Y
V
L
N
C
C
H
D
L
V
V
A
G
S
V
A
F
T
K
R
G
G
L
S
S
G
D
P
I
T
S
I
S
N
T
I
Y
S
L
V
L
Y
T
Q
H
M
L
L
C
G
L
E
G
Y
F
P
E
I
A
E
K
Y
L
D
G
S
L
E
L
R
D
M
F
K
Y
V
R
V
Y
I
Y
S
D
D
V
V
L
T
T
P
N
Q
H
Y
A
A
S
F
D
R
W
V
P
H
L
Q
A
L
L
G
F
K
V
D
P
K
K
T
V
N
T
S
S
P
S
F
L
G
C
R
F
K
Q
V
D
G
K
C
Y
L
A
S
L
Q
D
R
V
T
R
S
L
L
Y
H
I
G
A
K
N
P
S
E
Y
Y
E
A
A
V
S
I
F
K
D
S
I
I
C
C
D
E
D
W
W
T
D
L
H
R
R
I
S
G
A
A
R
T
D
G
V
E
F
P
T
I
E
M
L
T
S
F
R
T
K
Q
Y
E
S
A
V
C
T
V
C
G
A
A
P
V
A
K
S
A
C
G
G
W
F
C
G
N
C
V
P
Y
H
A
G
H
C
H
T
T
S
L
F
A
N
C
G
H
D
I
M
Y
R
S
T
Y
C
T
M
C
E
G
S
P
K
Q
M
V
P
K
V
P
H
P
I
L
D
H
L
L
C
H
I
D
Y
G
S
K
E
E
L
T
L
V
V
A
D
G
R
T
T
S
P
P
G
R
Y
K
V
G
H
K
V
V
A
V
V
A
D
V
G
G
N
I
V
F
G
C
G
P
G
S
H
I
A
V
P
L
Q
D
T
L
K
G
V
V
V
N
K
A
L
K
N
A
A
A
S
E
Y
V
E
G
P
P
G
S
G
K
T
F
H
L
V
K
D
V
L
A
V
V
G
S
A
T
L
V
V
P
T
H
A
S
M
L
D
C
I
N
K
L
K
Q
A
G
A
D
P
Y
F
V
V
P
K
Y
T
V
L
D
F
P
R
P
G
S
G
N
I
T
V
R
L
P
Q
V
G
T
S
E
G
E
T
F
V
D
E
V
A
Y
F
S
P
V
D
L
A
R
I
L
T
Q
G
R
V
K
G
Y
G
D
L
N
Q
L
G
C
V
G
P
A
S
V
P
R
N
L
W
L
R
H
F
V
S
L
E
P
L
R
V
C
H
R
F
G
A
A
V
C
D
L
I
K
G
I
Y
P
Y
Y
E
P
A
P
H
T
T
K
V
V
F
V
P
N
P
D
F
E
K
G
V
V
I
T
A
Y
H
K
D
R
G
L
G
H
R
T
I
D
S
I
Q
G
C
T
F
P
V
V
T
L
R
L
P
T
P
Q
S
L
T
R
P
R
A
V
V
A
V
T
R
A
S
Q
E
L
Y
I
Y
D
P
F
D
Q
L
S
G
L
L
K
F
T
K
E
A
E
A
Q
D
L
I
H
G
P
P
T
A
C
H
L
G
Q
E
I
D
L
W
S
N
E
G
L
E
Y
Y
K
E
V
N
L
L
Y
T
H
V
P
I
K
D
G
V
I
H
S
Y
P
N
C
G
P
A
C
G
W
E
K
Q
S
N
K
I
S
C
L
P
R
V
A
Q
N
L
G
Y
H
Y
S
P
D
L
P
G
F
C
P
I
P
K
E
L
A
E
H
W
P
V
V
S
N
D
R
Y
P
N
C
L
Q
I
T
L
Q
Q
V
C
E
L
S
K
P
C
S
A
G
Y
M
V
G
Q
S
V
F
V
Q
T
P
G
V
T
S
Y
W
L
T
E
W
V
D
G
K
A
R
A
L
P
D
S
L
F
S
S
G
R
F
E
T
N
S
R
A
F
L
D
E
A
E
E
K
F
A
A
A
H
P
H
A
C
L
G
E
I
N
K
S
T
V
G
G
S
H
F
I
F
S
Q
Y
L
P
P
L
L
P
A
D
A
V
A
L
V
G
A
S
L
A
G
K
A
A
K
A
A
C
S
V
V
D
V
Y
A
P
S
F
E
P
Y
L
H
P
E
T
L
S
R
V
Y
K
I
M
I
D
F
K
P
C
R
L
M
V
W
R
N
A
T
F
Y
V
Q
E
G
V
D
A
V
T
S
A
L
A
A
V
S
K
L
I
K
V
P
A
N
E
P
V
S
F
H
V
A
S
G
Y
R
T
N
A
L
V
A
P
Q
A
K
I
S
I
G
A
Y
A
A
E
W
A
L
S
T
E
P
P
P
A
G
Y
A
I
V
R
R
Y
I
V
K
R
L
L
S
S
T
E
V
F
L
C
R
R
G
V
V
S
S
T
S
V
Q
T
I
C
A
L
E
G
C
K
P
L
F
N
F
L
Q
I
G
S
V
I
G
P
V
|
Cofactor |
No current data |
Active site |
ACT_SITE 164 164 For Nsp1 papain-like cysteine proteinase activity. {ECO:0000269|PubMed:1331507, ECO:0000269|PubMed:8617757}.; ACT_SITE 230 230 For Nsp1 papain-like cysteine proteinase activity. {ECO:0000269|PubMed:1331507}.; ACT_SITE 270 270 For Nsp2 cysteine proteinase activity. {ECO:0000269|PubMed:7622476}.; ACT_SITE 332 332 For Nsp2 cysteine proteinase activity. {ECO:0000269|PubMed:7622476}.; ACT_SITE 1103 1103 Charge relay system; for 3C-like serine proteinase activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00826}.; ACT_SITE 1129 1129 Charge relay system; for 3C-like serine proteinase activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00826}.; ACT_SITE 1184 1184 Charge relay system; for 3C-like serine proteinase activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00826}. |
Pfam |
PF16749
PF12581
PF14755
PF14754
PF05412
PF05579
PF00680
PF17873
PF01443
PF17977
|
InterPro |
IPR027351
IPR031932
IPR038451
IPR008743
IPR023338
IPR008741
IPR025773
IPR027355
IPR023183
IPR022230
IPR029323
IPR008760
IPR037227
IPR032786
IPR027417
IPR009003
IPR041053
IPR001205
IPR007094
IPR041361
|