Uniprot ID | Q65900 |
Uniprot Name | POLG_CX16G |
Taxonomy ID | 69159 |
Sequence |
M
G
S
Q
V
S
T
Q
R
S
G
S
H
E
N
S
N
S
A
S
E
G
S
T
I
N
Y
T
T
I
N
Y
Y
K
D
A
Y
A
A
S
A
G
R
Q
D
M
S
Q
D
P
K
K
F
T
D
P
V
M
D
V
I
H
E
M
A
P
P
L
K
S
P
S
A
E
A
C
G
Y
S
D
R
V
A
Q
L
T
I
G
N
S
T
I
T
T
Q
E
A
A
N
I
I
I
A
Y
G
E
W
P
E
Y
C
K
D
A
D
A
T
A
V
D
K
P
T
R
P
D
V
S
V
N
R
F
F
T
L
D
T
K
S
W
A
K
D
S
K
G
W
Y
W
K
F
P
D
V
L
T
E
V
G
V
F
G
Q
N
A
Q
F
H
Y
L
Y
R
S
G
F
C
V
H
V
Q
C
N
A
S
K
F
H
Q
G
A
L
L
V
A
I
L
P
E
Y
V
L
G
T
I
A
G
G
D
G
N
E
N
S
H
P
P
Y
V
T
T
Q
P
G
Q
V
G
A
V
L
T
N
P
Y
V
L
D
A
G
V
P
L
S
Q
L
T
V
C
P
H
Q
W
I
N
L
R
T
N
N
C
A
T
I
I
V
P
Y
M
N
T
V
P
F
D
S
A
L
N
H
C
N
F
G
L
I
V
V
P
V
V
P
L
D
F
N
A
G
A
T
S
E
I
P
I
T
V
T
I
A
P
M
C
A
E
F
A
G
L
R
Q
A
I
K
Q
G
I
P
T
E
L
K
P
G
T
N
Q
F
L
T
T
D
D
G
V
S
A
P
I
L
P
G
F
H
P
T
P
A
I
H
I
P
G
E
V
R
N
L
L
E
I
C
R
V
E
T
I
L
E
V
N
N
L
Q
S
N
E
T
T
P
M
Q
R
L
C
F
P
V
S
V
Q
S
K
T
G
E
L
C
A
V
F
R
A
D
P
G
R
N
G
P
W
Q
S
T
I
L
G
Q
L
C
R
Y
Y
T
Q
W
S
G
S
L
E
V
T
F
M
F
A
G
S
F
M
A
T
G
K
M
L
I
A
Y
T
P
P
G
G
G
V
P
A
D
R
L
T
A
M
L
G
T
H
V
I
W
D
F
G
L
Q
S
S
V
T
L
V
I
P
W
I
S
N
T
H
Y
R
A
H
A
K
D
G
Y
F
D
Y
Y
T
T
G
T
I
T
I
W
Y
Q
T
N
Y
V
V
P
I
G
A
P
T
T
A
Y
I
V
A
L
A
A
A
Q
D
N
F
T
M
K
L
C
K
D
T
E
D
I
E
Q
S
A
N
I
Q
G
D
G
I
A
D
M
I
D
Q
A
V
T
S
R
V
G
R
A
L
T
S
L
Q
V
E
P
T
A
A
N
T
N
A
S
E
H
R
L
G
T
G
L
V
P
A
L
Q
A
A
E
T
G
A
S
S
N
A
Q
D
E
N
L
I
E
T
R
C
V
L
N
H
H
S
T
Q
E
T
T
I
G
N
F
F
S
R
A
G
L
V
S
I
I
T
M
P
T
T
G
T
Q
N
T
D
G
Y
V
N
W
D
I
D
L
M
G
Y
A
Q
M
R
R
K
C
E
L
F
T
Y
M
R
F
D
A
E
F
T
F
V
A
A
K
P
N
G
E
L
V
P
Q
L
L
Q
Y
M
Y
V
P
P
G
A
P
K
P
T
S
R
D
S
F
A
W
Q
T
A
T
N
P
S
I
F
V
K
L
T
D
P
P
A
Q
V
S
V
P
F
M
S
P
A
S
A
Y
Q
W
F
Y
D
G
Y
P
T
F
G
A
H
P
Q
S
N
D
A
D
Y
G
Q
C
P
N
N
M
M
G
T
F
S
I
R
T
V
G
T
E
K
S
P
H
S
I
T
L
R
V
Y
M
R
I
K
H
V
R
A
W
I
P
R
P
L
R
N
Q
P
Y
L
F
K
T
N
P
N
Y
K
G
N
D
I
K
C
T
S
T
S
R
D
K
I
T
T
L
G
K
F
G
Q
Q
S
G
A
I
Y
V
G
N
Y
R
V
V
N
R
H
L
A
T
H
N
D
W
A
N
L
V
W
E
D
S
S
R
D
L
L
V
S
S
T
T
A
Q
G
C
D
T
I
A
R
C
D
C
Q
T
G
V
Y
Y
C
S
S
R
R
K
H
Y
P
V
S
F
S
K
P
S
L
I
F
V
E
A
S
E
Y
Y
P
A
R
Y
Q
S
H
L
M
L
A
V
G
H
S
E
P
G
D
C
G
G
I
L
R
C
Q
H
G
V
V
G
I
V
S
T
G
G
N
G
L
V
G
F
A
D
V
R
D
L
L
W
L
D
E
E
A
M
E
Q
G
V
S
D
Y
I
K
G
L
G
D
A
F
G
T
G
F
T
D
A
V
S
R
E
V
E
A
L
K
N
H
L
I
G
S
E
G
A
V
E
K
I
L
K
N
L
I
K
L
I
S
A
L
V
I
V
I
R
S
D
Y
D
M
V
T
L
T
A
T
L
A
L
I
G
C
H
G
S
P
W
A
W
I
K
A
K
T
A
S
I
L
G
I
P
I
A
Q
K
Q
S
A
S
W
L
K
K
F
N
D
M
A
N
A
A
K
G
L
E
W
I
S
N
K
I
S
K
F
I
D
W
L
K
E
K
I
I
P
A
A
K
E
K
V
E
F
L
N
N
L
K
Q
L
P
L
L
E
N
Q
I
S
N
L
E
Q
S
A
A
S
Q
E
D
L
E
A
M
F
G
N
V
S
Y
L
A
H
F
C
R
K
F
Q
P
L
Y
A
T
E
A
K
R
V
Y
A
L
E
K
R
M
N
N
Y
M
Q
F
K
S
K
H
R
I
E
P
V
C
L
I
I
R
G
S
P
G
T
G
K
S
L
A
T
G
I
I
A
R
A
I
A
D
K
Y
H
S
S
V
Y
S
L
P
P
D
P
D
H
F
D
G
Y
K
Q
Q
V
V
T
V
M
D
D
L
C
Q
N
P
D
G
K
D
M
S
L
F
C
Q
M
V
S
T
V
D
F
I
P
P
M
A
S
L
E
E
K
G
V
S
F
T
S
K
F
V
I
A
S
T
N
A
S
N
I
I
V
P
T
V
S
D
S
D
A
I
R
R
R
F
Y
M
D
C
D
I
E
V
T
D
S
Y
K
T
D
L
G
R
L
D
A
G
R
A
A
R
L
C
S
E
N
N
T
A
N
F
K
R
C
S
P
L
V
C
G
K
A
I
Q
L
R
D
R
K
S
K
V
R
Y
S
V
D
T
V
V
S
E
L
I
R
E
Y
N
N
R
Y
A
I
G
N
T
I
E
A
L
F
Q
G
P
P
K
F
R
P
I
R
I
S
L
E
E
K
P
A
P
D
A
I
S
D
L
L
A
S
V
D
S
E
E
V
R
Q
Y
C
R
D
Q
G
W
I
I
P
E
T
P
T
N
V
E
R
H
L
N
R
A
V
L
I
M
Q
S
I
A
T
V
V
A
V
V
S
L
V
Y
V
I
Y
K
L
F
A
G
F
Q
G
A
Y
S
G
A
P
K
Q
T
L
K
K
P
I
L
R
T
A
T
V
Q
G
P
S
L
D
F
A
L
S
L
L
R
R
N
I
R
Q
V
Q
T
D
Q
G
H
F
T
M
L
G
V
R
D
R
L
A
V
L
P
R
H
S
Q
P
G
K
T
I
W
V
E
H
K
L
I
N
I
L
D
A
V
E
L
V
D
E
Q
G
V
N
L
E
L
T
L
V
T
L
D
T
N
E
K
F
R
D
I
T
K
F
I
P
E
N
I
S
A
A
S
D
A
T
L
V
I
N
T
E
H
M
P
S
M
F
V
P
V
G
D
V
V
Q
Y
G
F
L
N
L
S
G
K
P
T
H
R
T
M
M
Y
N
F
P
T
K
A
G
Q
C
G
G
V
V
T
S
V
G
K
V
I
G
I
H
I
G
G
N
G
R
Q
G
F
C
A
G
L
K
R
S
Y
F
A
S
E
Q
G
E
I
Q
W
V
K
P
N
K
E
T
G
R
L
N
I
N
G
P
T
R
T
K
L
E
P
S
V
F
H
D
V
F
E
G
N
K
E
P
A
V
L
H
S
R
D
P
R
L
E
V
D
F
E
Q
A
L
F
S
K
Y
V
G
N
T
L
H
E
P
D
E
Y
I
K
E
A
A
L
H
Y
A
N
Q
L
K
Q
L
D
I
N
T
S
Q
M
S
M
E
E
A
C
Y
G
T
E
N
L
E
A
I
D
L
H
T
S
A
G
Y
P
Y
S
A
L
G
I
K
K
R
D
I
L
D
P
T
T
R
D
V
S
K
M
K
F
Y
M
D
K
Y
G
L
D
L
P
Y
S
T
Y
V
K
D
E
L
R
S
I
D
K
I
K
K
G
K
S
R
L
I
E
A
S
S
L
N
D
S
V
Y
L
R
M
A
F
G
H
L
Y
E
T
F
H
A
N
P
G
T
I
T
G
S
A
V
G
C
N
P
D
T
F
W
S
K
L
P
I
L
L
P
G
S
L
F
A
F
D
Y
S
G
Y
D
A
S
L
S
P
V
W
F
R
A
L
E
L
V
L
R
E
V
G
Y
S
E
E
A
V
S
L
I
E
G
I
N
H
T
H
H
V
Y
R
N
K
T
Y
C
V
L
G
G
M
P
S
G
C
S
G
T
S
I
F
N
S
M
I
N
N
I
I
I
R
T
L
L
I
K
T
F
K
G
I
D
L
D
E
L
N
M
V
A
Y
G
D
D
V
L
A
S
Y
P
F
P
I
D
C
L
E
L
A
R
T
G
K
E
Y
G
L
T
M
T
P
A
D
K
S
P
C
F
N
E
V
N
W
G
N
A
T
F
L
K
R
G
F
L
P
D
E
Q
F
P
F
L
I
H
P
T
M
P
M
K
E
I
H
E
S
I
R
W
T
K
D
A
R
N
T
Q
D
H
V
R
S
L
C
L
L
A
W
H
N
G
K
Q
E
Y
E
K
F
V
S
T
I
R
S
V
P
V
G
K
A
L
A
I
P
N
Y
E
N
L
R
R
N
W
L
E
L
F
|
Cofactor |
COFACTOR: RNA-directed RNA polymerase: Name=Mg(2+); Xref=ChEBI:CHEBI:18420; Evidence={ECO:0000250|UniProtKB:P03313}; Note=Requires the presence of 3CDpro or 3CPro. {ECO:0000250|UniProtKB:P03313}; |
Active site |
ACT_SITE 883 883 For Protease 2A activity. {ECO:0000250}.; ACT_SITE 901 901 For Protease 2A activity. {ECO:0000250}.; ACT_SITE 972 972 For Protease 2A activity. {ECO:0000250}.; ACT_SITE 1588 1588 For protease 3C activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU01222}.; ACT_SITE 1619 1619 For protease 3C activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU01222}.; ACT_SITE 1695 1695 For protease 3C activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU01222}.; ACT_SITE 2060 2060 For RdRp activity. {ECO:0000250|UniProtKB:P12296}. |
Pfam |
PF08727
PF00548
PF02226
PF00947
PF01552
PF00680
PF00073
PF00910
|
InterPro |
IPR003593
IPR000605
IPR014759
IPR027417
IPR014838
IPR036203
IPR000081
IPR000199
IPR009003
IPR003138
IPR002527
IPR001676
IPR033703
IPR001205
IPR007094
IPR029053
|