Uniprot ID | Q68772 |
Uniprot Name | RPOA_SHFV |
Taxonomy ID | 38143 |
Sequence |
M
F
C
E
C
P
R
S
N
L
V
V
M
C
S
G
A
F
C
C
V
L
C
G
H
R
R
R
P
R
P
A
S
E
S
D
R
A
K
Y
G
P
I
V
Q
Y
V
E
A
R
V
A
H
V
Y
S
G
L
E
G
R
Y
C
A
L
E
M
I
P
I
T
Y
G
N
K
F
P
Y
C
K
P
L
P
V
S
F
V
I
K
T
L
A
G
V
Q
G
D
L
T
R
L
E
E
T
P
L
P
G
G
Y
G
V
I
P
C
W
G
P
H
L
A
A
V
G
Y
L
S
P
A
H
V
G
R
D
W
F
E
G
A
T
H
A
I
V
H
I
G
S
Y
G
G
H
E
R
P
T
T
I
P
F
N
T
T
G
G
D
V
Y
Q
L
G
T
C
T
I
V
E
T
I
D
H
V
E
W
H
A
G
V
K
P
G
T
A
I
C
P
L
D
R
I
D
F
A
Q
K
V
I
T
A
F
P
E
G
F
L
A
N
K
A
W
L
G
D
K
R
G
T
L
K
V
E
A
D
P
E
T
A
A
L
S
F
E
H
G
R
C
W
L
K
L
F
P
D
P
A
C
E
L
T
T
A
S
T
F
G
Y
Q
L
N
C
G
V
Q
G
K
Y
I
A
R
R
L
Q
T
N
G
L
K
L
V
Q
N
Q
E
G
K
F
I
A
Y
T
F
H
R
G
S
W
L
G
H
I
G
H
A
D
E
S
V
P
P
D
C
Q
I
I
A
R
F
D
V
L
P
Y
N
E
W
S
P
L
P
L
L
K
L
P
G
K
T
Y
F
G
G
N
A
S
S
V
S
W
P
E
W
K
Y
D
E
Q
L
L
Y
A
D
S
L
T
A
G
F
C
W
L
Q
L
F
P
P
L
S
R
K
S
E
A
Q
R
A
I
L
A
Q
Q
V
N
N
Y
G
V
T
G
T
Y
L
E
Y
R
L
R
Q
Y
G
I
V
L
A
E
C
D
Y
G
E
H
Y
I
Y
A
A
A
S
D
S
S
I
R
H
I
S
P
V
P
I
H
D
R
H
H
V
F
V
T
R
L
T
A
R
F
G
A
F
D
E
G
F
D
L
G
F
G
T
R
Y
G
R
R
R
G
G
G
K
K
S
G
Q
S
S
G
V
R
A
P
G
R
T
T
P
D
L
A
G
D
W
G
K
A
V
D
D
Q
E
K
T
A
S
K
V
T
T
D
K
A
M
S
T
S
E
P
A
V
V
Q
V
G
C
E
T
K
P
V
A
D
A
A
A
V
P
A
S
V
N
S
T
G
C
A
L
L
P
V
Q
A
D
P
C
C
T
A
G
V
A
A
K
E
S
E
P
K
A
V
A
A
P
S
I
P
I
T
F
G
A
P
A
G
E
T
L
P
V
A
A
S
P
L
V
V
K
K
D
K
R
C
I
S
V
K
L
T
A
K
K
A
L
P
K
E
T
F
I
P
P
P
D
G
G
C
G
V
H
A
F
A
A
I
Q
Y
H
I
N
T
G
H
W
P
E
Q
K
P
V
V
N
W
A
Y
E
A
W
T
T
N
E
D
I
G
H
M
I
C
S
T
E
T
P
A
A
L
E
P
C
L
H
A
R
Y
V
V
R
L
D
S
D
H
W
V
V
D
H
Y
P
N
R
P
M
C
F
V
E
A
C
A
H
G
W
C
S
S
L
L
S
E
P
T
G
E
E
G
E
H
L
V
D
C
S
A
L
Y
D
C
L
G
K
F
R
N
G
T
E
F
A
D
T
V
L
G
L
S
K
T
A
H
C
C
N
K
R
V
P
T
P
R
K
Q
A
I
M
S
L
L
N
R
P
N
C
V
P
C
I
A
P
P
S
Q
V
R
T
V
D
P
S
Q
P
A
A
P
L
P
P
V
P
R
P
R
K
R
K
A
A
A
Q
Q
V
S
K
V
P
S
E
Q
D
P
S
L
A
H
D
P
P
E
K
P
D
S
V
R
P
P
K
L
G
Y
L
D
R
A
W
N
N
M
L
A
R
T
H
K
L
H
N
L
Q
Q
R
V
F
G
L
Y
P
Q
L
L
S
M
L
L
P
S
G
A
R
P
S
T
P
R
L
L
G
C
Y
F
S
M
A
V
A
M
F
F
L
F
L
G
S
P
L
F
I
L
C
A
V
L
A
G
V
I
A
P
S
A
R
Y
P
K
I
L
C
C
C
L
V
V
V
Y
I
C
T
L
F
A
D
A
I
S
S
V
C
D
N
D
D
A
D
C
R
A
F
L
S
D
L
G
D
R
Y
S
T
N
Q
P
V
Y
I
T
P
G
P
A
T
F
F
L
A
V
S
R
N
F
F
V
V
S
V
A
L
F
P
L
H
L
L
L
L
M
V
D
V
L
L
V
I
G
V
L
C
M
D
G
Y
C
F
R
C
F
S
R
C
V
R
K
A
P
E
E
V
S
L
L
T
I
P
Q
S
R
V
S
R
R
F
L
L
D
I
C
D
F
Y
S
A
P
P
V
D
I
I
R
L
A
T
G
L
N
G
C
F
R
G
D
Y
S
P
I
G
S
S
T
S
V
I
T
A
D
K
I
D
V
K
K
V
S
C
R
T
V
C
S
F
P
S
C
P
S
E
A
V
K
V
L
H
V
L
S
V
R
G
Q
M
C
A
H
N
E
Q
K
V
E
K
V
D
A
L
P
C
K
N
P
L
F
P
Y
D
L
S
S
K
K
I
V
P
V
D
S
G
T
Y
E
I
L
S
S
I
G
C
D
M
S
H
L
V
I
G
D
G
D
F
F
K
V
M
G
V
P
R
P
S
P
F
T
V
M
R
L
R
A
C
R
V
V
G
G
G
R
I
F
R
T
A
L
A
A
A
W
V
L
F
F
V
C
A
G
Y
W
V
Q
M
S
T
P
C
G
I
G
T
N
D
P
F
C
K
S
S
F
G
V
P
T
Y
V
N
Q
G
V
C
H
G
Q
Y
C
A
S
S
K
G
V
S
R
A
T
S
I
L
T
V
R
N
P
A
V
A
P
Y
I
V
L
A
A
C
L
V
Y
L
A
S
V
Y
V
P
G
I
I
E
V
S
L
L
V
L
N
A
L
L
P
A
G
P
A
I
S
A
L
R
T
L
V
M
I
I
A
A
P
H
L
S
M
K
Y
I
A
F
F
C
C
T
T
A
F
V
D
F
T
S
V
V
V
V
L
T
A
L
L
V
G
W
I
L
A
R
Y
T
G
I
G
G
F
V
T
P
Y
D
I
H
D
V
V
K
S
Q
R
D
G
V
A
V
A
N
A
P
P
N
T
Y
L
G
A
V
R
R
A
A
L
T
G
K
P
A
F
F
V
A
N
N
T
G
I
V
L
E
G
L
L
R
E
K
T
R
A
S
N
S
V
S
V
Y
G
V
T
C
G
S
G
G
L
F
S
D
G
N
N
T
V
C
L
T
A
T
H
V
C
G
N
N
K
A
V
V
D
Y
Q
G
T
R
Y
E
A
V
F
T
T
K
G
D
Y
A
S
A
V
V
P
I
P
G
A
F
P
P
L
K
F
A
P
Q
S
Y
T
G
R
A
Y
W
Y
A
N
T
G
V
E
T
G
F
V
G
T
T
G
C
L
V
F
S
G
P
G
D
S
G
S
P
I
I
T
P
D
G
L
I
V
G
V
H
T
G
S
D
S
K
G
S
G
A
Y
T
T
P
N
G
L
T
V
S
G
P
L
S
L
K
E
M
G
A
H
Y
E
G
P
I
V
D
V
P
T
R
L
P
R
N
V
H
N
D
T
K
S
V
P
Q
P
L
A
R
L
L
E
S
S
I
N
L
E
G
G
L
G
T
I
Q
L
I
I
V
A
V
V
L
W
K
Y
A
V
D
P
L
S
I
P
F
V
V
A
F
F
L
L
N
E
I
L
P
K
C
L
I
R
C
F
Y
N
Y
S
L
F
C
L
A
A
F
S
P
L
A
S
R
I
F
F
I
R
L
L
T
A
A
L
N
R
N
P
T
A
L
I
C
H
A
C
F
A
G
I
A
V
L
N
D
F
I
I
L
G
D
I
R
L
A
L
R
F
T
S
F
Y
V
V
G
V
N
H
D
A
I
A
I
A
V
I
G
A
L
V
C
V
A
A
C
C
L
E
L
F
G
L
P
Q
M
A
S
V
I
G
C
H
G
S
F
D
P
T
F
L
S
R
Y
V
H
E
G
I
R
Q
G
V
S
S
G
F
G
T
E
S
L
S
T
A
L
A
C
A
L
S
E
D
E
L
N
F
L
A
Q
A
V
D
H
K
A
I
V
S
A
I
H
V
H
K
T
L
Q
D
Y
I
L
S
K
N
A
K
I
L
R
A
S
L
A
S
V
H
A
N
H
N
A
S
K
A
L
A
S
L
D
K
F
L
Q
G
T
S
T
Q
L
K
P
G
D
P
V
I
L
L
G
S
T
S
A
E
L
V
S
V
F
S
G
D
S
E
Y
I
A
E
P
I
R
S
H
P
V
A
G
T
I
C
T
L
C
V
V
Q
A
K
C
E
G
G
L
V
T
Q
V
N
G
K
F
S
P
A
K
Y
L
A
V
A
G
K
V
L
A
D
H
P
D
Y
K
L
E
N
D
G
R
F
P
R
T
R
E
D
R
V
K
D
S
V
Q
V
D
T
V
D
I
G
S
H
T
F
K
K
M
W
N
K
T
T
G
D
V
W
Y
D
I
I
M
P
E
S
A
A
N
P
L
A
V
H
D
L
D
S
A
V
A
A
I
G
M
S
K
E
I
P
E
K
D
M
N
R
L
R
A
I
I
S
K
L
Q
G
L
V
S
S
E
A
L
N
L
L
T
A
A
G
C
T
S
A
D
R
S
G
L
V
I
T
L
D
Y
A
K
I
I
T
H
H
A
R
T
R
A
F
S
S
I
D
F
K
V
V
S
P
D
E
A
M
R
T
A
R
L
S
P
S
P
Q
P
I
I
A
S
F
S
D
D
K
F
L
L
L
R
R
H
P
P
S
L
L
D
V
L
T
K
G
L
D
A
T
C
R
E
P
L
H
S
P
G
D
Q
G
I
D
G
Y
L
W
D
F
E
A
P
H
S
K
E
A
I
W
L
S
N
Q
I
I
S
A
C
A
A
R
R
G
D
A
P
G
C
Y
P
Y
K
L
H
P
V
R
G
D
P
Y
R
V
G
N
V
L
K
N
T
R
F
G
D
V
T
Y
T
A
V
S
D
S
D
S
P
W
L
K
V
A
S
I
N
S
G
G
C
P
V
V
T
D
R
V
L
G
S
T
I
P
V
G
S
E
I
Y
L
P
T
L
P
E
S
V
L
D
Y
L
D
S
R
P
D
C
P
T
Y
Y
T
Q
H
G
C
E
A
A
A
L
Q
D
L
K
K
F
N
L
S
T
Q
G
F
I
L
P
E
V
L
N
I
V
R
N
Y
L
L
G
T
I
G
Y
R
P
A
I
Y
K
P
S
T
V
P
S
N
D
S
H
A
G
I
N
G
L
S
F
S
T
K
T
L
Q
A
L
P
D
I
D
E
L
C
E
K
A
I
A
E
V
W
Q
T
V
T
P
V
T
L
K
K
Q
F
C
S
K
A
K
T
R
T
I
L
G
T
N
A
M
A
S
L
A
L
R
A
L
L
S
G
V
T
Q
G
F
Q
L
A
G
K
N
S
P
I
C
L
G
K
S
K
F
D
P
C
T
F
E
V
K
G
R
C
L
E
T
D
L
A
S
C
D
R
S
T
P
A
I
V
R
H
F
A
T
K
L
L
F
E
M
A
C
A
E
R
A
L
P
L
Y
V
V
N
C
C
H
D
L
I
V
T
Q
T
S
A
A
T
K
R
G
G
L
S
S
G
D
P
V
T
S
I
A
N
T
I
Y
S
L
V
L
Y
V
Q
H
M
V
L
T
L
L
E
N
G
H
P
L
S
L
K
F
L
S
G
K
L
N
F
Q
D
L
Y
K
L
Q
A
F
I
V
Y
S
D
D
L
I
L
L
N
E
S
D
D
L
P
N
F
E
R
W
V
P
H
L
E
L
A
L
G
F
K
V
D
P
K
K
T
V
I
T
S
N
P
G
F
L
G
C
E
Y
R
H
G
W
L
V
P
Q
K
Q
R
V
L
A
A
L
A
Y
H
V
N
A
K
D
V
H
T
Y
Y
I
N
A
T
A
I
L
N
D
A
S
A
L
S
A
F
E
P
D
W
F
D
D
L
V
I
G
L
A
D
C
A
R
K
D
G
Y
S
F
P
G
P
A
A
F
R
E
F
F
S
R
V
S
G
Y
Q
F
E
G
K
E
V
Q
V
C
S
I
C
C
S
T
A
R
T
T
S
L
C
G
M
A
L
C
D
F
C
A
H
R
H
Y
H
P
G
C
H
V
L
S
S
F
C
K
H
V
I
G
S
N
T
C
K
M
C
S
I
P
I
L
K
D
R
T
K
F
A
E
L
L
A
S
D
Q
Y
R
S
V
C
T
V
E
V
T
V
V
D
G
Y
T
D
A
A
P
G
R
Y
S
Y
Q
K
K
Q
Y
M
L
R
K
E
R
R
G
C
P
L
D
L
P
D
G
K
Y
S
M
K
L
L
P
N
S
C
S
G
I
C
V
P
K
A
Q
E
N
A
T
L
S
N
F
V
V
G
P
P
G
S
G
K
T
T
F
I
S
N
L
L
D
D
D
A
V
V
Y
C
P
T
H
V
S
L
I
A
Y
S
K
S
L
P
A
A
R
F
S
V
P
R
G
Q
D
P
A
E
Y
G
T
P
A
L
S
G
P
T
L
Q
L
L
S
A
G
Y
V
P
G
A
K
H
Y
L
D
E
A
C
Y
A
N
P
F
D
V
F
K
L
L
S
K
T
P
I
T
A
I
G
D
P
A
Q
L
T
P
V
G
F
D
T
P
L
Y
V
F
E
L
M
K
K
N
A
L
H
A
I
Y
R
F
G
Q
N
I
C
N
A
I
Q
P
C
Y
S
T
K
L
V
S
Q
R
Q
G
D
T
E
V
I
F
Q
T
K
F
A
P
R
G
K
V
L
T
P
Y
H
R
D
R
V
G
A
A
V
T
I
D
S
S
Q
G
S
T
Y
D
V
V
T
L
Y
L
P
T
K
G
S
L
T
L
A
R
G
L
V
G
I
T
R
A
R
E
R
L
Y
V
Y
D
P
H
H
Q
L
A
K
Y
F
N
L
Q
P
S
S
T
T
I
R
P
H
A
V
V
I
D
G
K
A
R
V
M
L
S
D
K
C
Y
A
A
P
E
D
F
P
G
M
L
C
T
A
R
P
A
T
A
A
D
R
K
I
L
E
E
T
C
L
K
L
D
F
L
E
S
G
S
L
S
P
L
P
R
V
C
Y
N
L
G
F
Y
Y
S
P
D
I
T
K
L
L
P
I
P
S
E
L
A
K
H
W
P
V
A
T
N
R
N
N
P
E
W
P
N
R
L
V
V
S
A
T
R
L
S
P
L
S
H
P
A
V
C
A
G
Y
Y
V
G
D
S
L
F
V
G
T
P
N
V
T
S
Y
W
L
T
K
F
L
D
G
R
A
V
P
M
E
D
S
V
Y
S
T
G
R
F
E
M
D
I
R
D
Y
L
D
S
A
E
R
D
F
A
A
K
H
P
H
A
F
I
G
D
T
K
G
T
T
V
G
G
C
H
H
I
T
S
Q
Y
L
P
H
V
L
P
A
D
S
V
V
K
V
G
V
S
K
P
G
V
A
H
K
A
L
C
T
V
T
D
I
Y
L
P
M
L
G
S
Y
T
S
P
P
T
Q
S
K
V
Y
K
V
N
V
D
H
K
A
C
K
L
M
V
W
R
D
Q
T
M
Y
F
Q
E
G
F
D
Y
H
T
L
V
D
A
L
R
F
V
R
L
S
S
D
G
V
Y
R
V
A
P
E
L
T
P
M
I
G
N
R
R
L
D
L
G
A
K
P
L
R
P
V
D
L
A
I
T
P
W
D
D
P
K
C
E
F
L
V
T
H
A
S
P
F
D
M
S
D
E
F
L
L
V
N
A
F
D
F
I
K
E
D
L
L
G
K
S
V
T
P
V
Y
F
Y
K
R
L
S
E
P
L
H
F
D
Q
N
L
P
P
H
V
G
A
I
L
S
K
A
P
R
F
I
S
L
A
K
V
F
N
F
C
F
T
P
T
A
C
H
C
K
V
S
V
K
T
A
T
G
D
H
M
C
K
C
S
L
S
S
D
E
F
L
S
R
F
N
P
T
V
G
T
P
|
Cofactor |
No current data |
Active site |
ACT_SITE 63 63 For Nsp1-alpha papain-like cysteine proteinase activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00872}.; ACT_SITE 130 130 For Nsp1-alpha papain-like cysteine proteinase activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00872}.; ACT_SITE 246 246 For Nsp1-beta papain-like cysteine proteinase activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00873}.; ACT_SITE 309 309 For Nsp1-beta papain-like cysteine proteinase activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00873}.; ACT_SITE 378 378 For Nsp2 cysteine proteinase activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00871}.; ACT_SITE 430 430 For Nsp2 cysteine proteinase activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00871}.; ACT_SITE 1502 1502 Charge relay system; for 3C-like serine proteinase activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00826}.; ACT_SITE 1527 1527 Charge relay system; for 3C-like serine proteinase activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00826}.; ACT_SITE 1580 1580 Charge relay system; for 3C-like serine proteinase activity. {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00826}. |
Pfam |
PF16749
PF05411
PF05412
PF05579
PF00680
PF01443
|
InterPro |
IPR027351
IPR031932
IPR038451
IPR008743
IPR023338
IPR008741
IPR025773
IPR038154
IPR027355
IPR008760
IPR037227
IPR027417
IPR009003
IPR001205
IPR007094
|